Поиск мотивов в геномах хлоропластов и митохондрий

На сегодняшний день в базе данных митохондриальных геномов 8863, хлоропластных - 2918

Буквенные коды для обозначения нуклеотидов
Код Означает Комплементарная пара
A A T в ДНК; U в РНК
C C G
G G C
T или U T в ДНК; U в РНК A
M A или C K
R A или G Y
W A или T W
S C или G S
Y C или T R
K G или T M
V A или C или G B
H A или C или T D
D A или G или T H
B C или G или T V
X или N A или C или G или T (U) любой

Буквенные коды нуклеотидных оснований приведены согласно номенклатуре NC-IUB

Пример: если вы введете строку "AAKGGGGGGGGGGGGA", это будет означать, что вы ищете последовательности, содержащие либо "AAGGGGGGGGGGGGGA", либо "AATGGGGGGGGGGGGA", потому что K соответствует, согласно таблице, или G, или T. Все символы набираются латиницей.
Выдача ограничена 50-ю первыми последовательностями. Лучше, чтобы запрос выдал вам меньше 50 записей, значит, он выдал все.
Если вы знаете, как ваша последовательность называется в базе NCBI, или ее латинское название - введите свои соображения, если это больше одной буквы.
Названия в файлах FASTA выглядят приблизительно так:

>NC_014057.1 Pisum sativum chloroplast, complete genome

Это про горох. Если набрать, например, часть слова "pisu", это сильно ограничит и конкретизирует поиск. Но если вы наберете слово "горох", вам сайт не выдаст ничего, никакого ИИ тут нет, даже как у пушки, самого минимального.


Митохондриальные геномы
Хлоропластные геномы
Искомая последовательность
Часть названия (если знаете)


Вопросы отправляйте на почту denik1@list.ru